自临床专业开办以来，南京医科大学的优质师资均长期承担我院临床医学专业的教学任务。临床医学专业的公共课、专业基础课、专业课的教学任务均由南京医科大学基础医学院、第一临床医学院、第二临床医学院、第四临床医学院等相关学院承担。现有江苏省“青蓝工程”培养对象2人，江苏省双创博士4人，江苏省“六大人才高峰培养对象”16人，江苏省“333高层次人才培养工程”29人。

学院2013年迁址连云港办学后，针对新的办学实际，学院以全面提高师资队伍素质为目标，努力建立符合连云港地区经济发展实际和专业办学特点的师资引进、培养的长效机制。一方面，积极做好专业负责人和课程负责人的遴选工作，聘请了一附院李爱民院长担任专业负责人，将一附院、附属连云港市中医院、附属连云港市第二人民医院、附属连云港市东方医院等各临床科室中具备优质资历的行业精英纳入教师队伍，并就教学方法邀请南医大专家督导组进行教学培训，组织参加岗前培训和教师资格证的考试工作；另一方面，加大自有师资的招聘培养力度，组织本专业青年教师到临床一线参加实践锻炼，积累临床实践经验，并通过邀请大校专家来港集体备课、示范性教学、举行讲座等形式提高了学院青年教师的教学水平和综合素质。